Stories about crops and statistics (plus coding)
JK Today I’ll explain what the Hardy–Weinberg principle is. The concept of genetic equilibrium, also known as Hardy-Weinberg equilibrium, describes the idealized conditions in a population where the allele frequencies remain constant over time. It assumes that certain conditions are met, including a large population size, random mating, no mutation, no migration, no selection, and no … Read more
It has been a dry day for a long time in Champaign. I arrived in Champaign on June 11th, 2023, and since then, I haven’t seen any rain. All the fields are extremely dry now. Of course, if it’s dry, it would be okay because we can find any GxE interaction and phenotypic plasticity in … Read more
Crops utilize carbon dioxide (CO2) from the atmosphere to undergo photosynthesis. In other words, photosynthesis is the process in which crops, within their chloroplasts, utilize light energy to synthesize glucose (C6H12O6) from carbon dioxide (CO2) and water (H2O). Photosynthesis occurs in the chloroplasts located in the leaves of crops, where the Calvin cycle takes place, … Read more
“슬기로운 어바나-샴페인 생활 101” 은 제가 초기 정착 때 경험한 것들을 시간별로 정리해서 새롭게 오시는 분들에게 필요한 정보를 공유하는 것을 목적으로 하는 프로젝트 입니다. 목차1. 한국에서 어바나-샴페인 (Urbana-Champaign) 가는 방법2. 어바나-샴페인에서 집 구하기 가이드3. 일리노이 주 운전면허 필기시험 기출문제 한국어 번역: 이것만 보고 가시면 무조건 필기 합격!!4. 일리노이주 운전면허 신청 방법5. UIUC 학생증/교직원 카드 신청하기6. … Read more
“슬기로운 어바나-샴페인 생활 101” 은 제가 초기 정착 때 경험한 것들을 시간별로 정리해서 새롭게 오시는 분들에게 필요한 정보를 공유하는 것을 목적으로 하는 프로젝트 입니다. 목차1. 한국에서 어바나-샴페인 (Urbana-Champaign) 가는 방법2. 어바나-샴페인에서 집 구하기 가이드3. 일리노이 주 운전면허 필기시험 기출문제 한국어 번역: 이것만 보고 가시면 무조건 필기 합격!!4. 일리노이주 운전면허 신청 방법5. UIUC 학생증/교직원 카드 신청하기6. … Read more
“슬기로운 어바나-샴페인 생활 101” 은 제가 초기 정착 때 경험한 것들을 시간별로 정리해서 새롭게 오시는 분들에게 필요한 정보를 공유하는 것을 목적으로 하는 프로젝트 입니다. 목차1. 한국에서 어바나-샴페인 (Urbana-Champaign) 가는 방법2. 어바나-샴페인에서 집 구하기 가이드3. 일리노이 주 운전면허 필기시험 기출문제 한국어 번역: 이것만 보고 가시면 무조건 필기 합격!!4. 일리노이주 운전면허 신청 방법5. UIUC 학생증/교직원 카드 신청하기6. … Read more
I successfully wrapped up the final details with the research team in Canada. My PI took me to a Major League Baseball game, where I watched a Toronto Blue Jays game at the stadium. After receiving an offer from the University of Illinois in early March, I decided to accept it. Feeling a bit sorry, … Read more
목차1. 한국에서 어바나-샴페인 (Urbana-Champaign) 가는 방법2. 어바나-샴페인에서 집 구하기 가이드3. 일리노이 주 운전면허 필기시험 기출문제 한국어 번역: 이것만 보고 가시면 무조건 필기 합격!!4. 일리노이주 운전면허 신청 방법5. UIUC 학생증/교직원 카드 신청하기6. 은행계좌 개설하기7. 의료보험 가입하기8. 대중교통 (버스) 이용하기9. 학교 식당 (Dining hall) 10. 한식재료 구매하기###S1. 세금 환급 (Tax Refund) 받기 (feat. 세금환급 대행 회사 추천)S2. … Read more
“슬기로운 어바나-샴페인 생활 101” 은 제가 초기 정착 때 경험한 것들을 시간별로 정리해서 새롭게 오시는 분들에게 필요한 정보를 공유하는 것을 목적으로 하는 프로젝트 입니다. 목차1. 한국에서 어바나-샴페인 (Urbana-Champaign) 가는 방법2. 어바나-샴페인에서 집 구하기 가이드3. 일리노이 주 운전면허 필기시험 기출문제 한국어 번역: 이것만 보고 가시면 무조건 필기 합격!!4. 일리노이주 운전면허 신청 방법5. UIUC 학생증/교직원 카드 신청하기6. … Read more
“슬기로운 어바나-샴페인 생활 101” 은 제가 초기 정착 때 경험한 것들을 시간별로 정리해서 새롭게 오시는 분들에게 필요한 정보를 공유하는 것을 목적으로 하는 프로젝트 입니다. 목차1. 한국에서 어바나-샴페인 (Urbana-Champaign) 가는 방법2. 어바나-샴페인에서 집 구하기 가이드3. 일리노이 주 운전면허 필기시험 기출문제 한국어 번역: 이것만 보고 가시면 무조건 필기 합격!!4. 일리노이주 운전면허 신청 방법5. UIUC 학생증/교직원 카드 신청하기6. … Read more
“슬기로운 어바나-샴페인 생활 101” 은 제가 초기 정착 때 경험한 것들을 시간별로 정리해서 새롭게 오시는 분들에게 필요한 정보를 공유하는 것을 목적으로 하는 프로젝트 입니다. 목차1. 한국에서 어바나-샴페인 (Urbana-Champaign) 가는 방법2. 어바나-샴페인에서 집 구하기 가이드3. 일리노이 주 운전면허 필기시험 기출문제 한국어 번역: 이것만 보고 가시면 무조건 필기 합격!!4. 일리노이주 운전면허 신청 방법5. UIUC 학생증/교직원 카드 신청하기6. … Read more
“슬기로운 어바나-샴페인 생활 101” 은 제가 초기 정착 때 경험한 것들을 시간별로 정리해서 새롭게 오시는 분들에게 필요한 정보를 공유하는 것을 목적으로 하는 프로젝트 입니다. 목차1. 한국에서 어바나-샴페인 (Urbana-Champaign) 가는 방법2. 어바나-샴페인에서 집 구하기 가이드3. 일리노이 주 운전면허 필기시험 기출문제 한국어 번역: 이것만 보고 가시면 무조건 필기 합격!!4. 일리노이주 운전면허 신청 방법5. UIUC 학생증/교직원 카드 신청하기6. … Read more
There is a corn experimental field as shown below. While regular corn farmers typically sow the entire field at once without dividing it into plots, researchers divide the field into plots and differentiate treatments to derive experimental results. The yield data obtained from field experiments should be in the common unit used by farmers, which … Read more
외국은 그렇지 않은 거 같은데 한국은 저널의 SCI(E) 등재 여부, Impact Factor 를 무척이나 따지는 것 같습니다. 과거 가졌던 편견 중 하나는 한국이 뭔가 보수적이어서 논문 내용의 퀄리티가 아닌, 이런 뒤쳐져 보이는 지표를 따지는가 싶었지만, 예전에 Predatory journals 에 한번 우연히 들어가서 내용을 보다가 형편없는 중학생 리포트 숙제 같은 것도 연구 논문으로 출판될 수 있다는 … Read more
데이터의 정규화는 여러 가지 주요 이유로 데이터를 시각화 할 때 필요한데, 가장 중요한 이유는 척도의 균일성 (scale uniformity) 때문입니다. 서로 다른 데이터 변수들은 크게 다른 척도와 단위를 가질 수 있습니다. 예를 들어, 곡물 수확량은 Mg/ha 일 수 있고, 영양소 함량은 일반적으로 % 범위 내에 있을 수 있습니다. 이러한 데이터를 정규화 하면 단위가 다른 여러 개의 … Read more
I have 1,000 data points of measurements of the length (mm) and weight (mg) of wheat grains. With this data, I want to analyze the relationship between the length and weight of the wheat grain to propose an equation model that can predict grain weight. I will draw a graph to visualize the data. If … Read more
Previously, I scanned wheat grains to obtain the area of each grain, and then measured the weight of each grain corresponding to its area in order to develop a model equation. The following regression demonstrates the relationship between grain area and weight. You can download this data in Kaggle. # Data download https://www.kaggle.com/datasets/agronomy4future/wheat-grain-area-vs-weight Alternatively, you … Read more
A factorial experiment involves the simultaneous manipulation of multiple factors or independent variables (x) to study their effects on a dependent variable (y). The experiment is called factorial because it involves testing multiple factors simultaneously. In factorial experiments, the combination of the different levels of each factor being tested is called a factorial, and each … Read more
This is my experimental data. There are 10 corn varieties, and I want to analyze the effect of nitrogen treatments (N0, N1) on grain yield for each variety. This is One-Way ANOVA analysis. Let’s assume that there are no blocks for the replicates. Therefore, the statistical model will be a One-Way ANOVA with no blocks. … Read more
One of the problems that can occur when drawing graphs using R is that the x-axis of the graph is sorted alphabetically. There is data as shown above. I used this data to create a graph as shown below. The above graph displays Amonium Sulfate first according to alphabetical order. However, I want to show … Read more
I’ll now show you how to change the order of variables in a graph. For this example, I have prepared some data and will create a graph using it. Now, let’s re-order the variables so that Calcium Nitrate comes first, followed by Urea, then Sodium Nitrate, and lastly Ammonium Sulfate. First, let’s take a look … Read more
If you need to change the text of a specific column while analyzing data in R, I will introduce how to do it. First, let’s create a simple dataset First, let’s rename the column names. We will change the ‘Nation’ column name to ‘Country’ and the ‘Sex’ column name to ‘Gender’. If you enter the … Read more
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I have the following data. Nitrogen Sulphur Rep Yield 0 0 1 1.0 0 0 2 0.9 0 0 3 0.8 N1 S1 1 1.0 N1 S1 2 1.2 N1 S1 3 1.3 N1 S2 1 2.1 N1 S2 2 2.2 N1 S2 3 2.3 N2 S1 1 1.4 N2 S1 2 1.6 N2 S1 … Read more
Sometimes, I see many people organizing their data in columns, as shown in the example below. This format may seem convenient because it allows us to view all the data at once. However, it poses problems for data analysis, which fundamentally relies on variables — namely, independent and dependent variables. Download data file (.csv) https://github.com/agronomy4future/raw_data_practice/blob/main/yield_per_location.csv … Read more
When we draw regression lines for a group, they are usually of the same type, such as simple linear regression. Here is an example using yield data for different nitrogen rates per genotype. Then, the regression graph for each group would be shown below. I think it would be better to show the quadratic regression … Read more
1. Unisexual flower a flower that has either male or female reproductive structures, but not both. Unisexuality can be divided into two categories. 1-1) Monoecious: a type of plant that has separate male and female flowers on the same plant. The representative plants of monoecious plants are corn and other Cucurbitaceae crops such as squash, … Read more
Before Getting Started!! This content applies only to bisexual flowers. If it is not a bisexual flower, there is no reason to use cytoplasmic male sterility for seed production. It is recommended to read the post below first. □ Sexual Classification of Plants ■ Male Sterility: the condition in which plants are unable to produce … Read more
To gain a basic understanding of the topic, I recommend reading the following posts. Analysis of Covariance (ANCOVA) I have a dataset as shown below, and I would like to analyze crop yield, and height based on different fertilizer types (Control, Slow-release, and Fast-release). The experimental design is a Completely Randomized Design (CRD) with 10 … Read more
캐나다 워크퍼밋을 신청하고 최종 워크퍼밋 비자를 받기까지 넉달이 걸린 반면 미국 J1 비자 신청을 위한 DS-2019 를 받는 것에는 3주가 걸렸습니다. 학교측에서 DS-2019 서류를 처리해 주는 것을 보면서 미국이 참 전산화가 잘 되어 있다는 생각을 했습니다. DS-2019 서류를 받은 뒤 J1 비자를 수령 받는 방법을 정리해 보았습니다. 1) DS-2019 서류 수령 미국 대학 측으로 부터 … Read more